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R语言实现PCA主成分分析图的示例代码
主成分分析(Principal Component Analysis,PCA)是一种无监督的数据降维方法,通过主成分分析可以尽可能保留下具备区分性的低维数据特征。主成分分析图能帮助我们直观地感受样本在降维后空间中的分簇和聚合情况,这在一定程...
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基于R语言 数据检验详解
1. W检验(Shapiro–Wilk (夏皮罗–威克尔 ) W统计量检验)目标:检验数据是否符合某正态分布,如:标准正态分布N(0,1)
R函数:shapiro.test().
结果含义:当p值小于某个显著性水平α(比如0.05)时,则认为样本不是来... -
R语言绘制Bubble Matrix气泡矩阵图
最近小仙同学刚经历了人生中的一个重要的里程碑——延毕。在预料之中、又如期而至的两个字,小仙心里也是很复杂,可终究跟“毕业”二字沾了边,就当它是好事啦!今天要给大家介绍的是气泡矩阵图,要模仿的...
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R语言绘制Radar chart雷达图示例教程
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R语言UpSet包实现集合可视化示例
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R语言R包ggtreeExtra绘制进化树
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R语言UpSet包实现集合可视化示例详解
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R语言批量读取某路径下文件内容的方法
R刚入门的时候,能够正确读取单个文件就觉得小有成就,随着时间的积累,单一文件地读取已经不能满足需求了,此时,批量地做就是解放双手地过程。使用for循环把下载地TCGA数据读入R语言并转换成数据框使用三个for循环来完成,这是...
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R语言学习之火山图的绘制详解
火山图用于展示基因表达差异的分布,横轴为Log2 Fold Change,越偏离中心差异倍数越大;纵轴为(-1)*Log10 P_adjust,值越大差异越显著。一般横轴越偏离中心的点其纵轴值也会比较大,因此呈现火山喷发的形状。一步绘制火山图输...
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R语言向量下标和子集的使用
1.正整数下标首先定义一个x,然后对向量 x, 在后面加方括号和下标可以访问向量的元素和子集,如: 定义一个x:x <- c(1, 4, 6.25)x返回:我们取出第二个元素:x[2]返回:我们再修改第二个元素为 99 :x[2] <- 99; x返回:我们再取下第...
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R语言绘制Facet violin plot小提琴刻面图实现示例
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R语言实现计算和绘制ROC曲线图效果
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R语言数据可视化绘制带误差线的条形图
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R语言ggplot2拼图包patchwork的安装使用方法
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R语言数据可视化绘图Dot plot(点图)的画法
